Der Quargelhersteller brachte den Quark von den Bauern, aus Märkten oder Molkereien in Tonnen nach Hause und wog ihn, um die genaue Menge Kochsalz festlegen zu können. Im Winter wurden 3,5 bis 4 kg Salz pro 100 kg zugegeben, im Sommer sogar 5 kg. Bei den mehr gesalzten Quargeln war der Reifungsprozess langsamer. Für 1-3 Tage blieb der Quark in niedrigen Fässern liegen, wo er verrührt wurde. Bei Mahlen in der Mühlen wurde das Kochsalz erst nach dem ersten, öfter nach dem zweiten Mahlen zugegeben (es wurde sogar vier Mal gemahlen), damit der Quark nicht „graupenförmig“ war.
Ursprünglich erfolgte die Verarbeitung des Quarks durch das Kneten. Es war die mühsamste Arbeitsphase bei der Herstellung. Das manuelle Kneten, sehr schwierig und langsam, wurde nur bei einer kleinen Menge Quark verwendet; der meist verwendete Verarbeitungsprozess war das Treten des Quarks mit nackten und gut gewaschenen Füßen. Zwei Mädchen und ein Mann traten eine 30 cm hohe Quarkschicht für eineinhalb Stunde bis zwei Stunden. Es ist nicht klar, wann man aufhörte, den Quark durch Kneten oder Treten zu verarbeiten, doch den Zeitgenossen nach ist es noch in den 30-er Jahren des 20. Jahrhunderts in Luké und Loštice nachgewiesen.
Der Quark, der nicht innerhalb von einigen Tagen in die Quargel verarbeitet wurde, wurde in den Fässern, oder später in Betonbehältern gelagert. In den Fässern, in einer Höhe von etwa 20 cm von unten, befanden sich Bohrungen um den Abfluss der Molke zu ermöglichen. In den Betonbehältern sorgten für den Abfluss der Molke die Nutenleisten auf dem Boden.
Der gesamte Verarbeitungsprozess des Quarks wurde durch die Quarkmühlen, vereinfacht und verbessert; diese verbreiteten sich sehr schnell seit der Jahrhundertwende vom 19. zum 20. Jahrhundert. Die Mühlen stellten oft die einzige Mechanisierung in den kleinen Quargelwerkstätten dar und das Mahlen wurde durch zwei gegeneinander rotierende Walzen gesichert. Die Mühlen hatten ursprünglich manuellen Antrieb, später dann meistens elektrischen Antrieb. Einige Quargelhersteller hatten die Vorbehalte, dass „keine Mühle die Füße ersetzen kann…“, doch der technische Fortschritt war dadurch nicht aufgehalten. Die Mühlen waren zuerst mit Holzwalzen, später dann mit Granit- oder Stahlwalzen, Stahlwalzen ausgestattet, wo es möglich war, den Abstand der Walzen oder den Druck der Feder auf die Walzen einzustellen. Der gegenseitige Abstand wurde gemäß dem Typ des Mahlens so eingestellt, dass sich der Raum zwischen den Walzen bei längerem Mahlen reduzierte. Die Fabrikherstellung der Quargel erforderte große Mühlen und eine Waage.
Eine Ergänzung des gesamten Mahlungsprozesses war eine Tonne, Wanne oder Kiste (eventuell mit Rollen), wohin der gemahlene Quark fiel. Wie in der Fachliteratur beschrieben ist: „… unten den Walzen gibt es ein verzinnter Holz- oder Eisenmesser für Sammlung (Abkratzen) des Quarks…“. Dieser konnte auch durch eine Stahlsaite, doch wieder verzinnte, ersetzt werden, denn es zu den Prinzipien eines Quargelherstellers gehörte, dass sich der Quark und das Eisen während der Herstellung nicht treffen dürfen. Das Verzinnen und die folgende Produktion wurden für die Quargelhersteller in der Klempnerwerkstätte Richard Mittag in Loštice durchgeführt.
Besonders sorgfältig musste der Quark für die manuelle Herstellung verarbeitet werden; bei den späteren, durch den Elektromotor angetriebenen Formmaschinen wurde der Quark noch mit der Antriebsschnecke geknetet, die den Quark in die Formmaschine zuführte. Wurde der Quark auf Lager gekauft, dann wurde er gemahlen und in die Fässer oder Betonbehälter mit einem Kolben eingestampft, doch öfter mit Treten. Der Quark konnte auch außen gelagert werden, und falls er erfror, war er bei vorsichtiger Behandlung noch für die Herstellung verwendbar. Für weitere Verarbeitung wurde dann der frisch verarbeitete Quark mit jenem gelagerten vermischt, meistens halb zu halb; der letztgenannte blieb sonst für die ganze Zeit belastet (meistens die mit Steinen oder Betonblöcken belasteten Platten). Bei der Lagerung in den Behältern wurde die Molke mittels spezieller Nuten in den Holzleisten auf dem Boden abgeführt. Für die Herstellung selbst musste der Quark so verarbeitet sein um aus ihm „klebriger Teig“ zu bekommen; der Quargelhersteller dürfte bei Betasten keine „Graupen“ fühlen. Für Beleuchtung der Werkstatt bei der Herstellung wurden die Petroleumlampen verwendet, später vereinzelt auch das Azetyllicht und alles änderte sich Anfang des 20. Jahrhunderts mit dem Strom. In Loštice entstand ein Stadtkraftwerk im Jahr 1909.